2016年，全国兽医工作的总体思路是，认真贯彻落实党的十八大和十八届三中、四中、五中全会，以及中央农村工作会议、全国农业工作会议精神，深入学习贯彻习近平总书记系列重要讲话精神，以“提质增效转方式、稳粮增收可持续”为主线，紧密围绕“防风险、保安全、促发展”的目标任务，全面加强从养殖到屠宰全链条兽医卫生风险管理，切实保障养殖业生产安全、动物源性食品安全、公共卫生安全和生态安全。
为落实这一思路，农业部提出从以下三方面加强兽医体系能力建设。
一是强化兽医队伍建设。严格官方兽医管理，制定官方兽医管理规章制度，健全教育培训和综合考评机制。优化执业兽医队伍发展环境，探索建立兽医执业条件标准，做好2016年执业兽医资格考试工作。加强乡村兽医考核、培训，严格乡村兽医登记备案管理。规范村级防疫员管理，制定村级防疫员参与动物防疫工作的管理办法，提高村级防疫员组织化水平。支持开展动物疫病防治比武等活动，营造兽医工作人员加强业务学习实践、提高综合素质的良好氛围。
二是抓好兽医机构核心能力建设。针对各级动物卫生监督、动物疫病预防控制、兽医药品监察、畜禽屠宰行业管理等机构，研究制定与职责任务相匹配的人员配置、经费保障、设施条件标准，促进核心能力建设，为兽医机构履职尽责，规范开展动物防疫、动物和动物产品检疫和兽医行政执法等兽医工作提供有力保障。
三是优化兽医机构协作关系。加强兽医行政管理、行政执法和技术支撑机构之间的衔接配合，健全基层动物疫病防控和监督执法工作的协调联动机制，确保信息互通、资源共享、协调联动、相互促进，以严格的监督执法保障动物疫病防控措施的有效落实，以强有力的技术支持促进兽医卫生监督执法工作科学开展。